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Binscy or FM/FM firtileハエ分譲依頼


Date: Tue, 18 Apr 2000 13:11:13 +0900 (JST)
From: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp (Masahiko Sakaguchi)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM firtileハエ分譲依頼

JFLYの皆様。初歩的質問を連発しております信州大教育の坂口です。エンハンサート
ラップに関する初歩的質問では、いとけいさんを始め、皆様には懇切丁寧に教えてい
ただきありがとうございました。

さて、私、今Binscy=In(1)sc-(上付)s1l sc-(上付)8R +dl-49, y sc-(上付)s1
sc-(上付)8 v Bがほしいのですが、国内でお持ちの方があれば分譲していただけな
いでしょうか?Binscy/Binscy雌を使いたいので。
遺伝研ホームページのshigen stock, JFLY stockいずれでもBinscyでkeyword検索で
ひっかかってこなかったので、JFLYにてお聞きいたします。

あるいはFlyviewホームページのゲッチンゲンX染色体プロジェクトで使っている
FM6:In(1)FM6, y31d sc8 w Bのような
FM/FMのfertileなホモ♀を生じる、y、Bをもつ系統でも結構です。

以上よろしくお願いいたします。

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坂口雅彦
〒380-8544 長野市西長野
信州大学 教育学部 理科教育 生物
Tel  026-238-4124 (Direct)
FAX 026-232-5144
E-mail: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp
http://msakaguchi.shinshu-u.ac.jp/
Masahiko Sakaguchi,
Shinshu University, Faculty of Education,
Nishinagano, Nagano, 380-8544 JAPAN
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Date: Tue, 18 Apr 2000 13:40:53 +0900
From: fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp (Yoshiaki FUYAMA)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM firtileハエ分譲依頼

yが入っていないとだめですか? fertileだけが条件ならば、Bascで
はいかがですか?

--
布 山 喜 章 : 東京都立大学大学院理学研究科生物学教室
Yoshiaki FUYAMA : Dept. of Biology, Tokyo Metropolitan University
     e-mail : fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp


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Date: Tue, 18 Apr 2000 14:29:35 +0900 (JST)
From: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp (Masahiko Sakaguchi)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

布山先生。すぐにご返事くださりありがとうございます。

>yが入っていないとだめですか? fertileだけが条件ならば、Bascで
>はいかがですか?

Basc=sc-(上付)8 sc-(上付)s1 w-(上付)a B-(上付)1ですよね。
Binscy=In(1)sc-(上付)s1l sc-(上付)8R +dl-49, y sc-(上付)s1 sc-(上付)
8 v B
だと素人に毛のはえた私でもyかy+で簡単にホモかヘテロかわかるからと思っている
のですが、

1. scのホモ、ヘテロも簡単に見分けられるのでしょうか?

2. Flybaseを調べてたら、sc-(上付)s1は腹の毛がしばしばはえてないように書い
てありましたが、そうするとSpが見えなくなるでしょうか?(見えなくてもまあいい
のですが)

3. Flybaseを調べてたら、sc-(上付)s1ホモ雌はsterile low viabilityとあるの
ですが、なぜ、Basc、Binscy共にホモfertileなのですか?sc-(上付)8もあるから
ですか?

またまた初歩的質問ですいません。
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坂口雅彦
〒380-8544 長野市西長野
信州大学 教育学部 理科教育 生物
Tel  026-238-4124 (Direct)
FAX 026-232-5144
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Masahiko Sakaguchi,
Shinshu University, Faculty of Education,
Nishinagano, Nagano, 380-8544 JAPAN
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Date: Tue, 18 Apr 2000 15:39:10 +0900
From: "YAMAMOTO, Masa-Toshi"
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM firtileハエ分譲依頼

Xバランサーホモの雌を使いたいようでしたら、FM7aではどうですか?
Bホモで維持していると、時々Bがなくなりますが。
山本雅敏(京都工芸繊維大学・ショウジョウバエ遺伝資源センター)


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Date: Tue, 18 Apr 2000 16:47:47 +0900 (JST)
From: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp (Masahiko Sakaguchi)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertile ハエ分譲依頼

山本先生。アドバイスありがとうございます。

FM7aで結構です。お持ちでしたら分譲していただけないでしょうか?
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坂口雅彦
〒380-8544 長野市西長野
信州大学 教育学部 理科教育 生物
Tel  026-238-4124 (Direct)
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Masahiko Sakaguchi,
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Nishinagano, Nagano, 380-8544 JAPAN
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Date: Wed, 19 Apr 2000 11:33:42 +0900
From: fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp (Yoshiaki FUYAMA)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

坂口様

山本さんのフォローで、解決済みですが、少し補足をば。

At 14:29 04/18/00 +0900, Masahiko Sakaguchi wrote:

>素人に毛のはえた私でもyかy+で簡単にホモかヘテロかわかるからと思っている
>のですが、
>
>1. scのホモ、ヘテロも簡単に見分けられるのでしょうか?

yあるいはscのホモとヘテロを見分ける必要がなぜあるのか理解
していないのですが、もし、バランサーのホモとヘテロを区別す
ることが目的なら、Bをみれば、素人に毛がはえていなくても一
目瞭然ですが(^^ゞ

>2. Flybaseを調べてたら、sc-(上付)s1は腹の毛がしばしばはえてないように書い
>てありましたが、そうするとSpが見えなくなるでしょうか?(見えなくてもまあいい
>のですが)
>
>3. Flybaseを調べてたら、sc-(上付)s1ホモ雌はsterile low viabilityとあるの
>ですが、なぜ、Basc、Binscy共にホモfertileなのですか?sc-(上付)8もあるから
>ですか?

In(1)sc[S1L]sc{8R]+S (Basc)やIn(1)sc[S1L]sc{8R]+dl49(Binscy)
というのは、いずれも逆位の名前です。どちらもホモで妊性があり
ます。たしかに、scのmutantを持っていますが、これは不妊の原因
ではないということでしょう。

これらのscのalleleはいずれもweak alleleで、特定の毛がやや短く
なるだけですので、素人に毛がはえた程度では見分けがつきにくい
です。したがって、Spの表現にはほとんど影響ないと思います。

--
布 山 喜 章 : 東京都立大学大学院理学研究科生物学教室
Yoshiaki FUYAMA : Dept. of Biology, Tokyo Metropolitan University
     e-mail : fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp


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Date: Wed, 19 Apr 2000 13:27:30 +0900 (JST)
From: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp (Masahiko Sakaguchi)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

布山先生。
>yあるいはscのホモとヘテロを見分ける必要がなぜあるのか理解
>していないのですが、もし、バランサーのホモとヘテロを区別す
>ることが目的なら、Bをみれば、素人に毛がはえていなくても一
>目瞭然ですが(^^ゞ
B/+とB/Bが違うのをうっかりしていました。そうですね。ただ、麻酔しなくても
y/+とy/yを区別して、吸虫管ですえるからyはいいですよね。
実は、RobertsのDrosophila, a practical approachP67にある、EMSなどによるsex l
inked lethal mutationsをやるのですが、yやwの入った染色体は行動がおかしいから
さけよとありますから、yなしのBascの方がいいのでしょうか?どなたかご経験のあ
るかたコメントいただけませんか?

>>3. Flybaseを調べてたら、sc-(上付)s1ホモ雌はsterile low viabilityとあるの
>>ですが、なぜ、Basc、Binscy共にホモfertileなのですか?sc-(上付)8もあるから
>>ですか?
>
>In(1)sc[S1L]sc{8R]+S (Basc)やIn(1)sc[S1L]sc{8R]+dl49(Binscy)
>というのは、いずれも逆位の名前です。どちらもホモで妊性があり
>ます。たしかに、scのmutantを持っていますが、これは不妊の原因
>ではないということでしょう。
かみつくようで申しわけありませんが、FlybaseでstockのBalancer searchでBascを
引くと、Markersとして
sc[S1L]がBなどとともにでてきて、それをクリックして調べると、mutant phenotype
にRather extreme sc allele,,,Homozygous female-stelile low viabilityとあり、
どうしてもBascのMarker phenotypeにsc[S1L]があるのに、fertileだというのが納得
できません。私が間違っているのはわかるのですが、なぜなのかわからないので教え
ていただけないでしょうか?
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坂口雅彦
〒380-8544 長野市西長野
信州大学 教育学部 理科教育 生物
Tel  026-238-4124 (Direct)
FAX 026-232-5144
E-mail: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp
http://msakaguchi.shinshu-u.ac.jp/
Masahiko Sakaguchi,
Shinshu University, Faculty of Education,
Nishinagano, Nagano, 380-8544 JAPAN
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Date: Wed, 19 Apr 2000 15:23:37 +0900
From: fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp (Yoshiaki FUYAMA)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

At 13:27 04/19/00 +0900, Masahiko Sakaguchi wrote:

>B/+とB/Bが違うのをうっかりしていました。そうですね。ただ、麻酔しなくても
>y/+とy/yを区別して、吸虫管ですえるからyはいいですよね。

なるほど、わかりました。

>実は、RobertsのDrosophila, a practical approachP67にある、EMSなどによるsex l
>inked lethal mutationsをやるのですが、yやwの入った染色体は行動がおかしいから
>さけよとありますから、yなしのBascの方がいいのでしょうか?どなたかご経験のあ
>るかたコメントいただけませんか?

yはたしかに交尾率は低いですが、lethal mutationsをみるのに差し支
えるほどではないでしょう。しかし、sex-linked lethalはMuller以来
Bascを使うのが定法ですね。別にきまりというわけではないと思いま
すが。

>かみつくようで申しわけありませんが、FlybaseでstockのBalancer searchでBascを
>引くと、Markersとして
>sc[S1L]がBなどとともにでてきて、それをクリックして調べると、mutant phenotype
>にRather extreme sc allele,,,Homozygous female-stelile low viabilityとあり、
>どうしてもBascのMarker phenotypeにsc[S1L]があるのに、fertileだというのが納得
>できません。私が間違っているのはわかるのですが、なぜなのかわからないので教え
>ていただけないでしょうか?

ここは山本さんの出番ですが。。。間違っていたら訂正してください。

Flybaseで確認したわけではありませんが、In(1)sc[S1L]ではなく、
In(1)sc[S1]ではありませんか? もし、[S1L]となっているとすれ
ば、Flybaseの間違いだと思います。

In(1)sc[S1]の場合、break pointがbb locus (rDNA)をかじっている
ために、ホモ接合雌がsemi-lethalでsterileになると理解しています。
雄では、Y染色体に正常遺伝子があるので、問題がないのですが。
要するに、生存力の低下や不妊はscが原因ではないということです。

一方、In(1)sc[S1L]sc[8R]では、In(1)sc[S1]とIn(1)sc[8] の組換え
によって、duplicationが生じ、この欠陥がカバーされるので、fertile
になると理解しています。




--
布 山 喜 章 : 東京都立大学大学院理学研究科生物学教室
Yoshiaki FUYAMA : Dept. of Biology, Tokyo Metropolitan University
     e-mail : fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp


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Date: Wed, 19 Apr 2000 19:43:21 +0900 (JST)
From: biologyアットマークgipwc.shinshu-u.ac.jp (Masahiko Sakaguchi)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

皆様。
少し間違えてました。

FlybaseでstocksのBalancers searchでBascを引くと、Markersとして
(sc[S1L]と前文で書きましたがそうでなく)sc[s1]がBなどとともにでてきて、それ
をクリックして調べると、mutant phenotypesにRather extreme sc allele,,,Homozy
gous female-stelile low viabilityとあり、
どうしてもBascのMarker phenotypeに(sc[S1L]と前文で書きましたがそうでなく)s
c[S1]があるのに、fertileだというのが納得できません。私が間違っているのはわか
るのですが、なぜなのかわからないので教えていただけないでしょうか?

と質問するべきでした。いずれにしても

>In(1)sc[S1]の場合、break pointがbb locus (rDNA)をかじっている
>ために、ホモ接合雌がsemi-lethalでsterileになると理解しています。
>雄では、Y染色体に正常遺伝子があるので、問題がないのですが。
>要するに、生存力の低下や不妊はscが原因ではないということです。
>
>一方、In(1)sc[S1L]sc[8R]では、In(1)sc[S1]とIn(1)sc[8] の組換え
>によって、duplicationが生じ、この欠陥がカバーされるので、fertile
>になると理解しています。

flybaseでsc[s1]を調べるとis associated with In(1)sc[S1]とありました。sc[s1]
のMutant phenotypesにHomozygous female-sterileと書いてあるのも、布山先生のお
っしゃるようなことであれば理解できました。sc[s1]を調べ、mutant phenotypesにH
omozygous female-sterileとかいてあるので、てっきりsc[s1]がsterileの原因と思
いこんでいました。
In(1)sc[S1L]sc[8R]では、In(1)sc[S1]とIn(1)sc[8] の組換えによって、duplicatio
nが生じ、この欠陥がカバーされるというのを知りませんでした。sc[S1L]のLとは、f
lybaseのscのallelesのところにs1Lはなく、s1しかないので、今だよくわからないの
ですが、Lとは組換えを起こしたという記号なのですか?

あまり初歩的質問を連発しても、ご迷惑かと思いますので、ここらで終わりたいとお
もいます。布山先生初め、みなさんありがとうございました。ショウジョウバエコミ
ュニティーの良さにふれ、成果はあがるかどうかわかりませんが、ハエを始めてよか
ったと思っています。では。
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坂口雅彦
〒380-8544 長野市西長野
信州大学 教育学部 理科教育 生物
Tel  026-238-4124 (Direct)
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Masahiko Sakaguchi,
Shinshu University, Faculty of Education,
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Date: Wed, 19 Apr 2000 21:02:08 +0900
From: "YAMAMOTO, Masa-Toshi"
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

少しばかりコメントさせて頂きます。

> >実は、RobertsのDrosophila, a practical approachP67にある、EMSなどによるsex l
> >inked lethal mutationsをやるのですが、yやwの入った染色体は行動がおかしいから
> >さけよとありますから、yなしのBascの方がいいのでしょうか?どなたかご経験のあ
> >るかたコメントいただけませんか?
>
>yはたしかに交尾率は低いですが、lethal mutationsをみるのに差し支
>えるほどではないでしょう。しかし、sex-linked lethalはMuller以来
>Bascを使うのが定法ですね。別にきまりというわけではないと思いま
>すが。

 私には、なぜwhiteが使えないのか不明です。非常に便利ですけど。viabilityが気
になるようであれば、野生型の系統などを用いてproximal側を置き換えるとか、実験
目的に合わせて系統を準備してから使用されてはいかがですか?
 Bascを使用する古典的な方法を紹介するあまり、それが常法だというように理解さ
れていると問題のように思います。染色体異常の応用技術も進歩していますので、新
しいバランサーを使用されてはいかがですか?

> >かみつくようで申しわけありませんが、FlybaseでstockのBalancer searchでBascを
> >引くと、Markersとして
> >sc[S1L]がBなどとともにでてきて、それをクリックして調べると、mutant phenotype
> >にRather extreme sc allele,,,Homozygous female-stelile low viabilityとあり、
> >どうしてもBascのMarker phenotypeにsc[S1L]があるのに、fertileだというのが納得
> >できません。私が間違っているのはわかるのですが、なぜなのかわからないので教え
> >ていただけないでしょうか?
>
>ここは山本さんの出番ですが。。。間違っていたら訂正してください。
>
>Flybaseで確認したわけではありませんが、In(1)sc[S1L]ではなく、
>In(1)sc[S1]ではありませんか? もし、[S1L]となっているとすれ
>ば、Flybaseの間違いだと思います。
>
>In(1)sc[S1]の場合、break pointがbb locus (rDNA)をかじっている
>ために、ホモ接合雌がsemi-lethalでsterileになると理解しています。
>雄では、Y染色体に正常遺伝子があるので、問題がないのですが。
>要するに、生存力の低下や不妊はscが原因ではないということです。
>
>一方、In(1)sc[S1L]sc[8R]では、In(1)sc[S1]とIn(1)sc[8] の組換え
>によって、duplicationが生じ、この欠陥がカバーされるので、fertile
>になると理解しています。

 布山さんの説明でいいと思いますが、実は不思議なんです。X染色体のセントロメ
アとrDNAの間に切断点を持つ逆位(sc[S1], sc[8], sc[L8]など)は、X/O
(雄ですが)でほとんどlethalか非常に低いviabilityを示します。これは、rDN
Aに働くposition effect variegationだと、私は考えています。その証拠となるデ
ータも持ち合わせています。雌の場合はX/Xになりますから、position effect
variegationの効果が低下し、生存できます。しかし、これが雌の妊性にどう関わっ
ているのか直接のデータを今思い出せません。ちなみに、rDNAを持たないY染色
体であるYbb[-]を持つ、sc[S1]/Ybb[-]は生存します。Yによりposition effect
variegationが抑えられるためと考えられます。
 In(1)sc[S1] homo femaleやIn(1)sc[L8] home femaleもsterileですが、これらの
雌にYを過剰に入れて、X/X/Y雌を作り妊性をテストする必要がありますね。以
前にやったと思うのですが、思い出せません。
 sc[S1L] sc[8R]ホモの雌が妊性がある理由、誰かが議論しているかどうかは、不明
です(私は知りません)。面白い問題なのですが。bascホモの雌はどれくらい妊性が
あるかについて教えてください。
 これは、御存じのことかも知れませんが、混乱がおきているのではないかと思いま
すので、付け加えておきます。sc[S1], sc[8], sc[L8]などとphenotypeに書かれてい
ても、どんなに玄人に毛が生えている人でもこれらを表現形で区別することは不可能
です。これらは全て逆位で生じた変異ですので、 variegationもありますし。

山本雅敏(京都工芸繊維大学・ショウジョウバエ遺伝資源センター)


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Date: Wed, 19 Apr 2000 21:09:32 +0900
From: "YAMAMOTO, Masa-Toshi"
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

ここらで終わりたいと言うメッセージを見ないで、先程メールを送ってしまいました。
ここで、最後に、基礎的なことが質問にありましたので、それに答えて私も終わりた
いと思います。


>flybaseでsc[s1]を調べるとis associated with In(1)sc[S1]とありました。sc[s1]
>のMutant phenotypesにHomozygous female-sterileと書いてあるのも、布山先生のお
>っしゃるようなことであれば理解できました。sc[s1]を調べ、mutant phenotypesにH
>omozygous female-sterileとかいてあるので、てっきりsc[s1]がsterileの原因と思
>いこんでいました。
>In(1)sc[S1L]sc[8R]では、In(1)sc[S1]とIn(1)sc[8] の組換えによって、duplicatio
>nが生じ、この欠陥がカバーされるというのを知りませんでした。sc[S1L]のLとは、f
>lybaseのscのallelesのところにs1Lはなく、s1しかないので、今だよくわからないの
>ですが、Lとは組換えを起こしたという記号なのですか?

Lとは組換えた結果生じた染色体の左側left(Xだとdistal側)がIn(1)sc[S1]由来
であることを意味します。、In(1)sc[S1L] sc[8R]とは、sc[S1]の左側とsc[8]の右側
を持った組み替え染色体であることを意味しています。それでは。

山本雅敏(京都工芸繊維大学・ショウジョウバエ遺伝資源センター)


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Date: Thu, 20 Apr 2000 11:16:14 +0900
From: fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp (Yoshiaki FUYAMA)
Subject: [Jfly] Binscy or FM/FM fertileハエ分譲依頼

山本様

補足(というか、訂正)ありがとうございました。

At 21:02 04/19/00 +0900, YAMAMOTO, Masa-Toshi wrote:

>ちなみに、rDNAを持たないY染色
>体であるYbb[-]を持つ、sc[S1]/Ybb[-]は生存します。Yによりposition effect
>variegationが抑えられるためと考えられます。

これは知りませんでした。「雄では、Y染色体に正常遺伝子があるので、
問題がない」というのは間違いですね。撤回します。

> sc[S1L] sc[8R]ホモの雌が妊性がある理由、誰かが議論しているかどうかは、不明
>です(私は知りません)。面白い問題なのですが。bascホモの雌はどれくらい妊性が
>あるかについて教えてください。

やはり、本当の所はわかっていないんですねぇー。In(1)sc[S1L] sc[8R]
が作られたいきさつは知りませんが、想像するに、たまたまfertileな子
供が出たということなんでしょうね。

Bascの妊性を調べたことはありませんが、飼育が困難という感じはあり
ませんので、著しく低いということはないと思います。



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布 山 喜 章 : 東京都立大学大学院理学研究科生物学教室
Yoshiaki FUYAMA : Dept. of Biology, Tokyo Metropolitan University
     e-mail : fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp