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PCR機種選定
Subject: [Jfly] PCR機種選定
Date: Sun, 19 Nov 00 18:21:10 +0900
From: Yasumitsu Takagi
J-flyの皆様
PCR反応において、プライマーの最適条件を簡単に決める目的で、温度勾配を設定で
きる増幅装置を選定するための情報を探しております。
使用経験とか噂とか、その他アドバイスしていただける事がありましたら、教えて
いただけないでしょうか。
＜in Japanese>
高木康光
福岡歯科大学・助教授
学術フロンティア研究センター
（〒８１４ー０１９３）
福岡市早良区田村２ー１５ー１
電話；０９２ー８０１ー０４１１（内線２３０）
ファックス；０９２ー８０１ー０６８５
電子メール；ytakaアットマークcollege.fdcnet.ac.jp
Yasumitsu Takagi, Ph.D.
Frontier Research Center,
Fukuoka Dental College
2-15-1 Tamura, Sawara-ku, Fukuoka, 814-0193, Japan
Tel/Fax; (+81)-92-801-0685
E-mail; ytakaアットマークcollege.fdcnet.ac.jp
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Date: Mon, 20 Nov 2000 17:39:04 +0900
Subject: [Jfly] PCR機種選定
From: Shuji Hanai
花井より返信。参考まで。
うちにはStratageneのRoboCycler40, 96があります。私は今は余り使っていませんが、
あまりぱっとした結果では有りませんでした。他の皆さんは少し前は条件決めに大分
役立っていました。
ここが○
４つの独立したアルミブロックでグラディエントが正確（メーカー曰く）
ロボットアームでチューブを移動するので温度変化が早い
ここが×
温度が安定するまでに時間が掛かる（余熱が必要）
温度変化が早すぎて、１ブロック式とは条件が大分違う
（別の機械でOKのサイクルを入れたら全く増えない事があった）
（Roboで条件決まればRoboで続ける）
ブロックにoilを入れる必要がある
（別売ヒートリッド装着ならtube中にはoilはいらない）
（チューブの外にoilつくし、お掃除もめんどう）
専用チューブでないとアームが引っかかる事がある
プログラムの仕方が分かりにくい
追伸
最近はAmpliTaqGoldのおかげで条件決め（温度&MgCl2）には余り苦しまなくなりまし
た。P-elementのI-PCRなどではGoldでないとnon-specificの山でした。人のがん遺伝
子やっていた皆さんはGC-richでPCR bufferのoptimizerやDMSOを使ったりと苦労して
いましたが、Goldにしてから劇的に楽になりました。