Jfly ディスカッション


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ゲノム DNA の抽出になぜ spermidine を加えるのか?


Date: Mon, 18 Feb 2002 15:56:24 +0900
From: Tamura Takuya
Subject: [Jfly] ゲノムの抽出

 東京都神経研の田村と申します。みなさんこんにちは。

 さて、皆様にゲノム抽出のことでお聞きしたいことがあります。これからハエのゲノム
を抽出しようと思うのですが、今調べたプロトコールでは homogenization bufferに
spermineや spermidineが入っています。 mammalから抽出する場合は必要ない試薬だと思
いますが、何のために入っているのでしょうか(生化学辞典には核酸の安定化と書いてあ
りましたが、だとしたら mammalでは入れない理由がわからない)?入れないと上手くいか
ないのでしょうか?皆様はどうしていますか?お答えいただければ幸いです。


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Date: Mon, 18 Feb 2002 20:29:53 +0900
From: mogamiアットマークbio.phys.s.u-tokyo.ac.jp (Kaname MOGAMI)
Subject: [Jfly] ゲノムの抽出

田村様

同じ疑問、だいぶ以前私もヘンにおもって省いたのですが、なにも
問題ありません。(実は安くあげたかっただけ、だったりして)

私たちのHomogenizing Bufferは
0.1M NaCl, 0.2M Sucrose, 0.1M Tris(pH9.1), 0.05M
EDTA, 0.5%SDS です。

最上(東大・理)


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Date: Wed, 18 Dec 2002 20:27:16 +0900
From: Makoto Hayashi
Subject: [Jfly] ゲノムの抽出

 筑波大学古久保研の林ともうします。
 現在、当研究室でインバースPCRを行っています。
 当研究室ではゲノム抽出の際のhomogenization bufferにspermineや
spermidine入れておりませんが、問題なくワークしています。

 プロトコルはBDGPの以下のサイトを参照しました。
http://www.fruitfly.org/about/methods/inverse.pcr.html



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林  誠
〒305-8572 つくば市天王台1-1-1
筑波大学 古久保-徳永研究室
TEL/FAX: 0298-53-4907 (研究室)
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Date: Tue, 19 Feb 2002 11:08:20 +0900
From: Tamura Takuya
Subject: [Jfly] ゲノムの抽出

 皆様貴重なご意見ありがとうございました、さっそく試してみようと思います。

田村 拓也