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flybaseのミラーサイトの不調
Date: Mon, 21 May 2001 13:16:43 +0900
From: TSUJIMURA Hidenobu
Subject: [Jfly] ｆｌybaseのミラーサイトについて
flybase について
資源研のflybaseのミラーサイト（http://shigen.lab.nig.ac.jp:7081）
ですが、例えば、Antpをgenesのところで検索しようとしても出ません。
indiana大学のサイトでは出ます。
どこかおかしいのではないでしょうか。または、当方の
使い方がおかしいのでしょうか。
ご存知の方はお教えください。
辻村秀信
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Date: Mon, 21 May 2001 13:43:27 +0900
From: "Murata, T. (RIKEN Tsukuba)"
Subject: [Jfly] ｆｌybaseのミラーサイトについて
村田アットマーク理研バイオリソースです。
うちも同じ症状です。
検索結果が「ヒットなし」になってしまいます。
Takehide MuraTa Ph. D.
Tsukuba Institute, RIKEN
Tsukuba Science City, Ibaraki 305-0074, Japan.
e-mail: tmurataアットマークrtc.riken.go.jp
HP: http://www.rtc.riken.go.jp/DNA/HTML/engsearch.html
phone: +81-298-36-3612, fax: +81-298-36-9120
>>>> Japanese Address <<<<
305-0074 茨城県 つくば市 高野台 3-1-1
理化学研究所 筑波研究所
村田 武英，研究員
//
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Date: Wed, 23 May 2001 18:12:21 +0900
From: fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp (Yoshiaki FUYAMA)
Subject: [Jfly] ｆｌybaseのミラーサイトについて
At 13:16 05/21/01 +0900, TSUJIMURA Hidenobu wrote:
> 資源研のflybaseのミラーサイト（http://shigen.lab.nig.ac.jp:7081）
>ですが、例えば、Antpをgenesのところで検索しようとしても出ません。
>indiana大学のサイトでは出ます。
gene searchが使えないのでは、ほとんど役に立ちませんね。
ところで、この事態について、サーバーの管理者は承知している
のでしょうか？ www.shigen.nig.ac.jpでは特にアナウンスはな
いようですが。
--
布 山 喜 章 : 東京都立大学大学院理学研究科生物学教室
Yoshiaki FUYAMA : Dept. of Biology, Tokyo Metropolitan University
e-mail : fuyama-yoshiakiアットマークc.metro-u.ac.jp
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Date: Wed, 23 May 2001 18:39:54 +0900
From: "ITO, Kei"
Subject: [Jfly] ｆｌybaseのミラーサイトについて
遺伝研関係者のレスポンスを待っているのですが、誰も反応してくれ
ませんねぇ。。。資源の部屋にちょっと内線で電話するなり足を運ぶ
なりしていただければ、と思うのだけれど。どなたかお願いできませ
ん？ ^^;;
> > 資源研のflybaseのミラーサイト（http://shigen.lab.nig.ac.jp:7081）
> >ですが、例えば、Antpをgenesのところで検索しようとしても出ません。
> >indiana大学のサイトでは出ます。
> ところで、この事態について、サーバーの管理者は承知している
> のでしょうか？ www.shigen.nig.ac.jpでは特にアナウンスはな
> いようですが。
ミラーサイト立ち上げ時に私が聞いた範囲では、遺伝研では所有する
サーバーにアメリカの本部からミラーを作るための環境設定を用意し
ているだけで、日々のアップデートはアメリカから直接行なわれ、遺
伝研の担当者は日常的にはタッチしていないと思います。（少なくと
も、私はそういう条件でミラーサイト設置の打診を受けたけど、Jfly,
Flybrain, Flybase ３つも面倒見るのは無理なので、断わった ^^;; ）
問題の切り分けとしては、
１：資源のサーバーの設定の不良
２：flybase の検索プログラムの設定不良（本部サイトでしか検索が
うまく働かないとか）
前者なら、問題は遺伝研のミラーサイトのみで発生するはずですし、
後者なら、遺伝研以外の複数のミラーサイトでも、似た症状が発生す
るはずです。前者の場合は遺伝研の計算機の設定をいじる必要がある
ので資源の人にいろいろやってもらう必要が出てきますが、後者の場
合は、flybase のプログラム設計者にバグを直してもらって、新バー
ジョンをミラーサイトにアップデートしてもらえば、解決すると思い
ます。というわけで、どなたか、各ミラーサイトで同じ検索を試して
みていただけませんか？遺伝研の人である必要はなく、どなたでも出
来ます。バグの原因を究明しやすくするためには、genes だけでなく
他の検索でも、どの検索は問題があってどれは問題がないか、表現型
をシステマティックにきちんと調べる必要がありますね。
有志の奮闘と貢献に期待します。^^;;
いとうκ
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From: "Shigeo Hayashi"
Subject: [Jfly] RE: [Jfly] ｆｌybase のミラーサイトについて
Date: Wed, 23 May 2001 18:49:52 +0900
Flybaseのミラーサイトについて説明しておきます。これは遺伝研、遺伝資源研究室
のサーバーを使ってFlybaseの担当者が定期的にアップデートしているものです。遺
伝資源研究室の山崎由紀子先生はハードの管理はなさっていますがFlybaseの内容に
ついては関与しておりません。したがってFlybaseのトラブルに関してはユーザーが
直接連絡コンタクトすべきものです。
今回のトラブルについては私からflybaseに報告しておきました。公的なデータ
ベースはユーザーからのフィードバックなくして適正な管理はできません。皆様のご
理解をお願いいたします。
林 茂生
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Date: Wed, 23 May 2001 18:58:00 +0900
From: Yasushi Hiromi
Subject: [Jfly] ｆｌybaseのミラーサイトについて
Jflyのみなさま，
Ｃｃ：山崎さん＠遺伝研
18:45に遺伝研のミラーサーバーの管理をして下さっている山崎さんにメールを出し
たところでした．18:39発信の伊藤啓さんのメールとクロスしたのでＣｃ：は辻村さ
んと布山さんにのみ出しました．私が試した限りでは，ミラーサイトでもpeople
searchはＯＫでした．
広海＠遺伝研
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Date: Wed, 23 May 2001 19:46:49 +0900
From: "ITO, Kei"
Subject: [Jfly] ｆｌybaseのミラーサイトについて
広海さん、林さん、山崎さん、
遺伝研の方でも迅速な対応をとっていただいていたようで、入れ違いに
失礼なことを書いて、申し訳ありませんでした。お詫びいたします。
ミラーサイトは、サイトごとにコンピューターの使用機種や OS、ファ
イルの配置場所などが微妙に異なったりして、大変な作業だと思います
が、問題箇所の発見が出来たら助かります。よろしくお願いいたします。
伊藤 啓
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Date: Wed, 23 May 2001 21:33:28 +0900
From: Yukiko YAMAZAKI
Subject: [Jfly] FlyBase mirror siteの不良について
JFLYの皆様へ
遺伝研でFlyBaseのミラーサイトを管理しております
山崎由紀子と申します。
検索機能の不良で皆様には大変ご迷惑をおかけして
おります。本当に申し訳ございません。
早急に対応いたします。ご利用いただけるようになりましたら
お知らせ申し上げますので、それまでIndianaのFlybase
http://flybase.bio.indiana.edu/
をご利用くださいますよう、お願いいたします。
かつて管理はすべて本部にお任せしておりましたが、セキュリテイの
問題から今では私のところですべての作業を行っております。
従いまして、何か不都合にお気づきの際には直接私宛にお知らせ
くださいますよう、お願い申し上げます。
今後ともどうぞよろしくお願いいたします。
山崎由紀子
yyamazakアットマークlab.nig.ac.jp
shigenアットマークlab.nig.ac.jp
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Date: Thu, 24 May 2001 18:58:09 +0900
From: Yukiko YAMAZAKI
Subject: [Jfly] FlyBase mirrorサービス再会しました
JFLYの皆様へ
FlyBaseのミラーサイトがご利用いただけるようになりましたので、
お知らせ申し上げます。せっかくアクセスしてくださってる多くの
皆様に大変ご迷惑をおかけしてしまいました。
本当にすみませんでした。
今後何か不具合にお気づきの際には、直接私宛でも結構ですし、
私もこれを機会にjflyのメーリングリストに加入させて
いただきましたので、このメーリングリストに投げていただいでも
結構です。
今後ともどうぞよろしくお願いいたします。
山崎由紀子
yyamazakアットマークlab.nig.ac.jp
shigenアットマークlab.nig.ac.jp
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Date: Thu, 24 May 2001 22:12:00 +0900
From: Yukiko YAMAZAKI
Subject: [Jfly] FlyBase JapanMirrorしばらく止めます
JFLYの皆様へ
先ほどサービス再開（漢字も違ってましたね）のお知らせメールを
送信したばかりですが、ミラーサイトの再構築が必要になってしまい
ましたので、サービスを一時止めさせていただきます。
ご理解の上、もうしばらくご辛抱くださいますよう、お願いいたします。
山崎由紀子
yyamazakアットマークlab.nig.ac.jp
shigenアットマークlab.nig.ac.jp