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fringe cDNA分与のお願い
Date: Thu, 10 May 2001 09:15:32 +0900
From: "橋本 康弘"
Subject: [Jfly] fringe cDNA分与のお願い
ショウジョウバエの研究をスタートしたいと考えている理研フロンティアの橋本と申
します。Drosophila fringe cDNA（acc No. L35770, CG10580）を分与していただき
たくメールをお送りしました。
BDGPの情報をもとにResearch Genetics社に注文したのですが、以下のトラブルのた
めに入手できませんでした。BDGPのGadFlyのMatches cDNAにGH01788というクローン
があると記載されておりました。これをもとに8641:1 and 2を注文しましたが、これ
はCG10589のものでありCG10580の近傍に逆ストランドで存在する遺伝子のcDNAクロー
ンでfringeとは全くホモロジーがありませんでした。BDGPの単純なミスであると解釈
いたしました。都立大学の中藤先生よりアドバイスを受け、jfly memberに分与をお
願いするのが良いとのことなので皆様にお願いいたしました。
fly base memberにおうかがいするのは筋違いかもしれませんが、哺乳動物の
fringeも入手したいと希望しております。human and mouseのM-, R-, and
L-fringeをクローニングしたProf. Thomas F. Vogtに手紙を書いたのですが、返事が
なく困っております。mouse, ratあるいはhumanなどのfringeを分与してくれる研究
者をご存じの方がありましたらお知らせ下さい。
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橋本 康弘
理研フロンティア
生体超分子システムグループ
糖鎖機能研究チーム・チームリーダー
351-0198 埼玉県和光市広沢２番地１号
YASUHIRO HASHIMOTO
Team Leader
Glyco-chain Functions Laboratory
Supra-biomolecular System Group
RIKEN Frontier Research System
2-1 Hirosawa, Wako-shi, Saitama 351-0198, JAPAN
Tel: +81-48-467-9613
Fax: +81-48-462-4690
Email: yasuaアットマークpostman.riken.go.jp
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From: Hirotaka Kanuka
Date: Thu, 10 May 2001 10:06:11 +0900
Subject: [Jfly] fringe cDNA分与のお願い
嘉糠＠理研三浦チームです。
fringeのESTですが、もう一つあります。BDGP BLASTのホームページ（http://www.fruitfly.org/blast/index.html）に行き、BLASTN及びESTを選択し、fringeのcDNA（5'-UTRを含むもの）をぶち込んで"Run search"を押せば、「HL07715」というESTが出てきます。
蛇足ですが、Research Genetics社（現インビトロゲン社）も含めてESTの発注は必ず複数個することをお奨めします。Jflyでも以前話題になりましたが、以下のようなことが往々にして起きます
1. EST入り大腸菌が起こせない（再発注してもダメなものはダメ）
2. EST入り大腸菌にファージがコンタミしていて使えない
3. 発注したのと全く異なるESTが届く
4. 同じゲノム上の別の転写産物のESTが届く（橋本さんのケース）
5. ESTの内部に1bpないし2bpの塩基のdeletionが見つかる（ライブラリー作成時のアーティファクトと思われる）
特に最後のケースは膨大な徒労に終わり、僕はこれまで２度経験しています。端だけシーケンスしてトランスジェニック作ったりするのは恐怖！です。ESTの充実のおかげで、ライブラリーを自分でスクリーニングするのに比べれば何十倍も楽になったわけですので、これくらいは我慢しないといけないのかも知れません。
嘉糠
kanukaアットマークbrain.riken.go.jp
理研・細胞修復（三浦チーム）
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Date: Thu, 10 May 2001 10:57:38 +0900
From: "橋本 康弘"
Subject: [Jfly] fringe cDNA分与のお願い
早速返信有り難うございました。私はショウジョウバエ研究に関しては全くの素人な
ので今後ともよろしくご教授お願い申し上げます。
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橋本 康弘
理研フロンティア
生体超分子システムグループ
糖鎖機能研究チーム・チームリーダー
351-0198 埼玉県和光市広沢２番地１号
YASUHIRO HASHIMOTO
Team Leader
Glyco-chain Functions Laboratory
Supra-biomolecular System Group
RIKEN Frontier Research System
2-1 Hirosawa, Wako-shi, Saitama 351-0198, JAPAN
Tel: +81-48-467-9613
Fax: +81-48-462-4690
Email: yasuaアットマークpostman.riken.go.jp
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