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Internal ribosome entry site (IRES)はショウジョウバエの脳内で機能するか
Date: Tue, 18 Dec 2001 16:21:32 +0900
From: Tomoyuki Miyashita
Subject: [Jfly] IRES
東京都神経研の宮下といいます。
Internal ribosome entry site (IRES)が
ショウジョウバエで機能するか知りたいのですが
どなたか御存知でしょうか？
以前遺伝研の岡部先生からも同様の質問がありましたが
どこからもレスポンスがなかったようなので・・・・
その後，試された方がいらしたら教えて下さい。
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> 皆様おはようございます。
> Internal ribosome entry site (IRES)がショウジョウバエの脳内で機能するかを知
> りたいのですが、どなたか御存じでしたら教えて下さい。
> よろしくおねがいします。
>
> 岡部正隆
……………………………………………………………
宮下 知之
東京都医学研究機構
東京都神経科学総合研究所
分子神経生理学部門
〒183-8526 東京都府中市武蔵台2-6
e-mail: mtomoアットマークtmin.ac.jp
TEL 042-325-3881 (内線. 4200,4221)
FAX 042-321-8678
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Date: Tue, 18 Dec 2001 17:21:22 +0900
Subject: [Jfly] IRES
From: Masataka Okabe
個人的にも返事はもらっていません。
岡部
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岡部正隆
国立遺伝学研究所 発生遺伝研究部門
総合研究大学院大学 生命科学研究科
〒411-8540 三島市谷田1111
TEL 0559-81-6809
FAX 0559-81-6768
http://www.nig.ac.jp/labs/DevGen/hiromi-j.html
Masataka Okabe M.D.,Ph.D
Division of Developmental Biology
National Institute of Genetics
TEL 81-559-81-6809
FAX 81-559-81-6768
色盲のためのバリアフリー活動をはじめました！
http://www.nig.ac.jp/labs/DevGen/shikimou.html
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From: "Shigeo Hayashi"
Subject: [Jfly] RE: [Jfly] IRES
Date: Tue, 18 Dec 2001 17:35:41 +0900
遺伝研 林です、
ホメオティック遺伝子には長いUTRがありIRESを用いて翻訳されます。これを用いた
コンストラクトも報告されています。
Development, Vol 122, Issue 3 747-751,
A test for cell autonomy, based on di-cistronic messenger translation
K Hart and M Bienz
http://dev.biologists.org/cgi/content/abstract/122/3/747
Oh, S.K., Scott, M.P., Sarnow, P.
Homeotic gene Antennapedia mRNA contains 5'-noncoding sequences that confer
translational initiation by internal ribosome binding.
Genes Dev. 1992 6(9):1643--1653
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Date: Tue, 18 Dec 2001 19:13:03 +0900
From: Kazushige Hamada
Subject: [Jfly] IRES
昆虫ウイルスのIRESでショウジョウバエで機能するものが報告されています。
J Virol 2001 Nov;75(21):10244-10249
The 5' untranslated region of Rhopalosiphum padi virus contains an internal
ribosome entry site which functions efficiently in mammalian, plant, and
insect translation systems.
Woolaway KE, Lazaridis K, Belsham GJ, Carter MJ, Roberts LO.
Mol Cell Biol 2000 Jul;20(14):4990-4999
Naturally occurring dicistronic cricket paralysis virus RNA is regulated by
two internal ribosome entry sites.
Wilson JE, Powell MJ, Hoover SE, Sarnow P
濱田＠京都工芸繊維大学
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Date: Wed, 19 Dec 2001 10:43:42 +0900
From: Toshiro Aigaki
Subject: [Jfly] IRES
相垣＠都立大です．
ショウジョウバエで体細胞クローン作製に使われているFRT cassette をもつコンス
トラクトでは，後ろのFRTの直後にIRESが入っている様です．FRT に挟まれた領域を
Flip-outしたあと，400base以上あるsingle copy のFRTが残るため，そのあとの翻訳
効率が下がらないようにしたものと思われます．IRES無しと比較したデータはないの
で，それがどの程度効果的かは確認していません．
相垣
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Date: Wed, 19 Dec 2001 11:36:12 +0900
From: Yuji Kageyama
Subject: [Jfly] IRES
奈良先端大の影山です。
At 10:43 AM +0900 01.12.19, Toshiro Aigaki wrote:
> ショウジョウバエで体細胞クローン作製に使われているFRT cassette をもつコンス
> トラクトでは，後ろのFRTの直後にIRESが入っている様です．FRT に挟まれた領域を
> Flip-outしたあと，400base以上あるsingle copy のFRTが残るため，そのあとの翻訳
> 効率が下がらないようにしたものと思われます．IRES無しと比較したデータはないの
> で，それがどの程度効果的かは確認していません．
G. Struhl にFRT cassette をいただいた際に添付されていた手紙には、tub>y+>hh
の construct
に使われている Antp 由来の IRES に着いての記述があります："We had hoped that
this would
improve the expression of the downstream coding sequence, but in fact it
seems to have no
effect." どうやって比較されたのかについては書かれておりませんが、劇的な効
果はなさそ
うです。
--
影山裕二
奈良先端科学技術大学院大学
バイオサイエンス研究科