 | Jfly ディスカッション |
Discussion Menu | Jfly Japanese Home Page | Jfly English Home Page
カイ２乗検定とt検定
Date: Sat, 11 Jan 2003 01:52:02 +0900
Subject: [Jfly] カイ２乗検定とt検定
From: Masahiko Sakaguchi
連続メールで申し訳ありませんが教えていただきたいことがあります。
ある遺伝子座の対立遺伝子A,aについて、ヘテロである個体Aaを劣性ホモ個体aaと交
配して得られる次世代の形質[A]:[a]=1:1（平均値に差がない）を検定する場合や、
嗅物質いりビンと水のビンのそれぞれにはいる数が１：１（平均値に差がない）であ
るかを検定する場合、
５回の測定でそれぞれ、X群とY群が
51：48
74：23
61：33
44：53
47：49
（計277：計206）
（平均は55.4と41.2）
（1：1の期待値は計241.5：計241.5）
となった場合、総数（計277：計206）を比較するカイ２乗検定では
カイ２乗＝10.4自由度1でP＝0.0015＝1/667
と1：1であるという仮説は5％ではもちろん１％でも棄却され、
平均値の差の有意性を調べるunpaired t検定(両側）では
tは1.802、自由度8、P＝0.109
となり5％では平均値が等しいという帰無仮説を棄却できません。
そうすると、X群とY群は１：１でないが、平均値は等しい
となるのでしょうか？
信州大学教育学部生物
坂口雅彦
＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊
Date: Sat, 11 Jan 2003 14:00:07 +0900
From: Yoshiaki FUYAMA
Subject: [Jfly] カイ２乗検定とt検定
坂口様
データが均一であるかどうかをheterogeneity testにかけてみました。
カイ二乗検定では、カイ二乗値=26.25、自由度=4、p=2.81e-5
尤度比検定 (Ｇテスト)では、 G=27.00、自由度=4、p=1.99e-5
となり、いずれも確率は0.1%以下であり、きわめて有意になります。
すなわち、上のデータは不均質であり、このようなデータをプールす
ることはできないというご託宣です。
以下、データが均質であると仮定しての話ですが、このようなデータを
unpaired t検定にかけるのはおかしいと思います。明らかに対応がある
わけですから。
もっとも、この場合、paired t-testでも、
t=1.27757、自由度＝4、p = 0.27051
となって、確率はunpairedよりむしろ高くなりますが。。。
一般的には、paired testではレプ間の分散が除かれますから、感度は
高くなります。
布 山 喜 章 : 東京都立大学大学院理学研究科生物学教室
Yoshiaki FUYAMA : Dept. of Biology, Tokyo Metropolitan University
w