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バイオリソース：BACライブラリーの作製
Date: Fri, 1 Aug 2003 20:04:54 +0900
From: "YAMAMOTO, Masa-Toshi"
Subject: [Jfly] ＤＧＲＣ・ニュース（ショウジョウバエ遺伝資源センター・ニュース）
■ＤＧＲＣニュース
［ゲノム解析事業：ＢＡＣライブラリーの作製］
「日本ショウジョウバエ研究会」総会で、ショウジョウバエ５種 (D.
simulans, D. melanogaster, D. ananassae, D. sechellia, D. auraria) の
ＢＡＣライブラリーが、理研で作製されていることをお知らせいたしました。
ＢＡＣライブラリーを有用な遺伝資源として活用するために、エンドシーケン シ
ングを行う申請をしておりましたところ、３種のＢＡＣライブラリーについ てエ
ンドシーケンシングを行うという回答を得ております。５種のＢＡＣライ ブラ
リーの中から、エンドシーケンシングを行う３種を決定する必要がありま す。ど
の種のライブラリーを解析の対象にするかについて、８月４日までに作 成機関で
ある理化学研究所ゲノム総合研究センターと打ち合わせを行い、解析 対象・解析
量を確認し、８月８日までに試料の調製に関する打ち合わせを行う こととの連絡
を受けております（７月３１日）。そこで、総会の時に８月半ば までに決定した
いと申しましたが、８月４日の午前中までに決定する必要が出 てまいりました。
エンドシーケンシングの解析であることから、D. aurariaの情報はさほどＢ
ＡＣライブラリーの有用性を高めるものではないこと、また、現在D.
melanogasterの情報は必要ではないこと、などの理由から、D. simulans, D.
ananassae, D. sechelliaの３種の解析を優先させるべきではないかと考えて い
ます。
この点に関して、皆さまからのご意見をお伺いいたします。ただし、８月４ 日
正午までに回答をお願いいたします。
山本 雅敏
京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センター
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Date: Sat, 2 Aug 2003 18:11:41 +0900
From: Toshiro Aigaki
Subject: [Jfly] ＤＧＲＣ・ニュース（ショウジョウバエ遺伝資源センター・ニュース）
山本様
相垣＠都立大です。
BACライブラリーのエンドシーケンシングに関しては、御提案の３種でよいと思います。
ついでにコメントです。
BACライブラリーを活用してもらうには、もう一段のサポートが必要だと思いま
す。 特定のBACクローンの同定や、その後のshotgun シーケンンシングなどのサ
ポートが あるかないかで、利用者の数はかなり変わると思います。これらのサ
ポートについ て、バイオリソースではどのように計画されているのでしょうか。
素朴な疑問ですが、D.melanogasterのBAC libraryが必要な理由はなんでしょう？
相垣敏郎
東京都立大学 理学研究科
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Date: Sat, 02 Aug 2003 18:46:07 +0900
Subject: [Jfly] ＤＧＲＣ・ニュース（ショウジョウバエ遺伝資源センター・ニュース）
From: matsuda
山本 雅敏 様
山本さん提案の３種で今回は良いと思います。出来れば，D. aurariaもやった方が良
いとは思いますが、次回ということで。
エンドシークエンスだけでなく、全シークエンスへの道を閉ざさず、機会のあるごと
に、やるべきであると主張をしていければと思います。その方が、ずっと有効に使わ
れると思っています。
松田宗男
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Date: Tue, 5 Aug 2003 11:35:32 +0900
From: "YAMAMOTO, Masa-Toshi"
Subject: [Jfly] ＤＧＲＣ・ニュース（ショウジョウバエ遺伝資源センター・ニュース）
回答ありがとうございました。
> ついでにコメントです。
> BACライブラリーを活用してもらうには、もう一段のサポートが必要だと思いま
> す。 特定のBACクローンの同定や、その後のshotgun シーケンンシングなどのサ
> ポートが あるかないかで、利用者の数はかなり変わると思います。これらのサ
> ポートについて、バイオリソースではどのように計画されているの でしょう
> か。
相垣さんのコメントは私としては十分に理解できます。
問題点として２つ挙げることが出来ます。
１．バイオリソースではこの点について具体的な計画を立てておりません、と い
うより、立てることが出来ない状態です。昨年度と今年度はゲノム解析事業 が並
行して行われることとなり、いくつかの生物種（今年度は、６種、７解 析）がそ
の対象となりましたが、来年度も継続されるかどうかという長期ビジ ョンがあり
ません。
２．バイオリソースでゲノム解析のサポートがあれば、利用者の数は変わるで
しょう。しかし、そのような状況を成立させるための研究上の必要性も利用者 側
から示していただく必要があります。出来るだけのお膳立てをする努力は致 しま
すが、利用者からの提案や、バイオリソース参加メンバーとの共同研究な どの計
画を進めることによって、バイオリソースとは別の形での具体化が早まるのでは
ないかと思います。
> 素朴な疑問ですが、D.melanogasterのBAC libraryが必要な理由はなんでしょう？
当初、ＢＡＣライブラリーの作製予定の中にD. melanogasterは入っていませんで
した。しかし、文部科学省からの回答の中には、この種が追加された形で 作製予
定に入っていました。
私も不思議には思いましたが、プレゼントだと考え、受けることとして、日本 の
野生型キイロショウジョウバエとして有名なHikone-Rをその対象に選定しま し
た。
山本 雅敏
京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センター