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キイロショウジョウバエ近縁種のゲノムシークエンスプロジェクト
Date: Wed, 21 Jan 2004 12:46:33 +0900
From: Toshiyuki Takano-Shimizu
Subject: [Jfly] sim/yak sequences (3605)
皆様、
国立遺伝学研究所の高野です。
一部、ご存じの方もいらっしゃいますが、genome science center @
washington university, st. louisでキイロショウジョウバエの近縁種のゲノム
シークエンスプロジェクトが進行しています。simulansを1x coverageで７系
統、yakubaを8x程度で１系統配列決定される予定です。chuck langley@uc,
davisを中心に draft assemblies and annotationへのearly accessのグループ間
協議のための会議が、今年３月のdrosophila confererenceの前日に同所で開催さ
れます。この会議の website (http://www.dpgp.org/sim_yak/index.html)が新設
されました。興味のある方はご覧下さい。現在までに３０程度のグループが興味
と会議への参加を予定しています。 early accessは配列決定、アセンブルしなが
らの情報を、したがってある程度エラーを含みながら、できるだけ早くから解析
が進められるこよう、便宜を図ったものです。ワークステーションベースで情報
のやりとりが行われます。公開が実際に いつになるかは私は現在のところ正確に
は掴んでいませんが、おそらく１年以内のかなり短い時間差で公開されることに
なると理解しています。
国立遺伝学研究所
高野敏行